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path: root/gnu/packages/bioinformatics.scm
AgeCommit message (Expand)Author
2025-01-23gnu: Add r-vitesscer.Ricardo Wurmus
2025-01-22gnu: Add r-sigfit.Alexis Simon
2025-01-22gnu: r-voltron: Update to 0.2.0-2.bbd7abb.Ricardo Wurmus
2025-01-22gnu: Add r-pizzarr.Ricardo Wurmus
2025-01-22gnu: python-biom-format: Add missing input.Ricardo Wurmus
2025-01-20gnu: Move python-pysnptools to (gnu packages bioinformatics).Ricardo Wurmus
2025-01-20gnu: Add python-bed-reader.Ricardo Wurmus
2025-01-20gnu: python-fanc: Update to 0.9.28.Ricardo Wurmus
2025-01-20gnu: Deprecate fanc.Ricardo Wurmus
2025-01-20gnu: python-screed: Update to 1.1.3.Ricardo Wurmus
2025-01-20gnu: python-mofax: Update to 0.3.7-1.e4821fe.Ricardo Wurmus
2025-01-20gnu: python-pybio: Fix build.宋文武
2025-01-20gnu: python-whatshap: Add missing input.Ricardo Wurmus
2025-01-20gnu: python-pyrodigal: Add missing input.Ricardo Wurmus
2025-01-20gnu: instrain: Update to 1.9.0.Ricardo Wurmus
2025-01-20gnu: scregseg: Patch for numpy compatibility.Ricardo Wurmus
2025-01-20gnu: python-episcanpy: Add missing input.Ricardo Wurmus
2025-01-20gnu: python-celltypist: Add missing input.Ricardo Wurmus
2025-01-20gnu: python-metacells: Update to 0.9.5.Ricardo Wurmus
2025-01-20gnu: python-scanpy: Patch anndata version check.Ricardo Wurmus
2025-01-20gnu: python-metacells: Add missing input.Ricardo Wurmus
2025-01-20gnu: python-liana-py: Update to 1.4.0.Ricardo Wurmus
2025-01-20gnu: python-decoupler-py: Add missing input.Ricardo Wurmus
2025-01-20gnu: python-cell2cell: Add missing input.Ricardo Wurmus
2025-01-20gnu: python-gseapy: Add missing input.Ricardo Wurmus
2025-01-20gnu: python-mudata: Update to 0.3.1.Ricardo Wurmus
2025-01-20gnu: python-scanpy: Update to 1.10.4.Ricardo Wurmus
2025-01-20gnu: cwltool: Patch tox.ini.Ricardo Wurmus
2025-01-20gnu: cwltool: Use test-flags.Ricardo Wurmus
2025-01-20gnu: python-cwl-utils: Add missing inputs.Ricardo Wurmus
2025-01-20gnu: python-cwl-upgrader: Add missing inputs.Ricardo Wurmus
2025-01-20gnu: python-schema-salad: Update to 8.8.20241206093842.Ricardo Wurmus
2025-01-20gnu: pyscenic: Update to 0.12.1-1.eaf23eb.Ricardo Wurmus
2025-01-20gnu: macs-3: Add missing input.Ricardo Wurmus
2025-01-20gnu: python-py2bit: Use pyproject-build-system.Ricardo Wurmus
2025-01-20gnu: python-biom-format: Use pyproject-build-system.Ricardo Wurmus
2025-01-16gnu: Add python-ngesh.Navid Afkhami
2025-01-15gnu: Add fast5.Ricardo Wurmus
2025-01-14gnu: python-cyvcf2: Update to 0.31.1Alexis Simon
2025-01-06gnu: rust-flate2-1: Move to (gnu packages crates-compression).Efraim Flashner
2025-01-05gnu: Fix whitespace issues in various descriptions.Gabriel Wicki
2025-01-01gnu: python-scanpy: Ignore plotting tests.Ricardo Wurmus
2025-01-01gnu: python-scanpy: Use more test-flags.Ricardo Wurmus
2025-01-01gnu: python-hicmatrix: Work around defect in python-tables.Ricardo Wurmus
2025-01-01gnu: python-pybedtools: Update to 0.10.0.Ricardo Wurmus
2024-12-22gnu: python-cwlformat: Fix build.Zheng Junjie
2024-12-21gnu: python-pyahocorasick: Fix build.Danny Milosavljevic
2024-12-18gnu: python-cwl-utils: Use node-lts instead of node.Jelle Licht
2024-12-18gnu: cwltool: Use node-lts instead of node.Jelle Licht
2024-12-15gnu: python-deeptools: Add missing inputs.Ricardo Wurmus